Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms