Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms