Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptf1aQ9QX98 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptf1aQ9QX98 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms