Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms