Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Rabgef1Q9JM13 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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