Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms