Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl28Q9JIL2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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