Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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