Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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DysfQ9ESD7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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DysfQ9ESD7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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DysfQ9ESD7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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DysfQ9ESD7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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DysfQ9ESD7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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DysfQ9ESD7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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DysfQ9ESD7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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DysfQ9ESD7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms