Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp29Q9ES63 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp29Q9ES63 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp29Q9ES63 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp29Q9ES63 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp29Q9ES63 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp29Q9ES63 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp29Q9ES63 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp29Q9ES63 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Usp29Q9ES63 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp29Q9ES63 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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Usp29Q9ES63 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp29Q9ES63 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Usp29Q9ES63 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Usp29Q9ES63 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Usp29Q9ES63 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Usp29Q9ES63 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Usp29Q9ES63 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Usp29Q9ES63 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp29Q9ES63 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp29Q9ES63 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp29Q9ES63 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp29Q9ES63 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp29Q9ES63 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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