Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sall1Q9ER74 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms