Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms