Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Rnf6Q9DBU5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Rnf6Q9DBU5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Rnf6Q9DBU5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Rnf6Q9DBU5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Rnf6Q9DBU5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rnf6Q9DBU5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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