Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Znf580Q9DB38 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf580Q9DB38 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Znf580Q9DB38 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf580Q9DB38 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf580Q9DB38 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf580Q9DB38 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf580Q9DB38 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf580Q9DB38 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Znf580Q9DB38 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Znf580Q9DB38 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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