Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms