Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms