Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmco5aQ9D9D5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmco5aQ9D9D5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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