Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ifi35Q9D8C4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms