Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4cQ9D7F7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms