Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Borcs6Q9D6W8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Borcs6Q9D6W8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Borcs6Q9D6W8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Borcs6Q9D6W8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Borcs6Q9D6W8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Borcs6Q9D6W8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Borcs6Q9D6W8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms