Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms