Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms