Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7Q9D541 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7Q9D541 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7Q9D541 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7Q9D541 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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