Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrameQ9D4Z5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms