Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce1Q9D495 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms