Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Snx29Q9D3S3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Snx29Q9D3S3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Snx29Q9D3S3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Snx29Q9D3S3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Snx29Q9D3S3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Snx29Q9D3S3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Snx29Q9D3S3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Snx29Q9D3S3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Snx29Q9D3S3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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