Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx20Q9D2Y5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms