Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D2Q3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D2Q3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D2Q3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9D2Q3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9D2Q3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D2Q3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D2Q3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D2Q3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D2Q3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D2Q3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D2Q3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9D2Q3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D2Q3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D2Q3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D2Q3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D2Q3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D2Q3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D2Q3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D2Q3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D2Q3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D2Q3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D2Q3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D2Q3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D2Q3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms