Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms