Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hddc3Q9D114 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms