Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms