Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms