Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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