Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms