Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Sgo1Q9CXH7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Sgo1Q9CXH7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Sgo1Q9CXH7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Sgo1Q9CXH7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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Sgo1Q9CXH7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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