Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Wdr55Q9CX97 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr55Q9CX97 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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