Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms