Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms