Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dis3Q9CSH3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms