Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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