Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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