Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms