Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccer1Q9CQL2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms