Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rdm1Q9CQK3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rdm1Q9CQK3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rdm1Q9CQK3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rdm1Q9CQK3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rdm1Q9CQK3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rdm1Q9CQK3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rdm1Q9CQK3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Rdm1Q9CQK3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Rdm1Q9CQK3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Rdm1Q9CQK3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Rdm1Q9CQK3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Rdm1Q9CQK3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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