Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms