Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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NenfQ9CQ45 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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NenfQ9CQ45 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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NenfQ9CQ45 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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NenfQ9CQ45 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NenfQ9CQ45 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms