Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pole4Q9CQ36 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pole4Q9CQ36 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pole4Q9CQ36 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pole4Q9CQ36 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pole4Q9CQ36 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pole4Q9CQ36 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pole4Q9CQ36 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pole4Q9CQ36 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms