Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bap1Q99PU7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bap1Q99PU7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms