Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim11Q99PQ2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim11Q99PQ2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim11Q99PQ2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim11Q99PQ2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim11Q99PQ2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim11Q99PQ2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim11Q99PQ2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim11Q99PQ2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim11Q99PQ2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim11Q99PQ2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim11Q99PQ2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim11Q99PQ2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim11Q99PQ2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim11Q99PQ2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim11Q99PQ2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim11Q99PQ2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim11Q99PQ2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim11Q99PQ2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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