Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms